Né aux Pays-Bas, Sloothaak a débuté la compétition équestre pour son pays, mais à la fin de l’adolescence, il part pour l’Allemagne faire son apprentissage chez le champion olympique de Montréal 1976, Alwin Schockemöhle.

En 1979, il devient citoyen allemand et participe désormais aux championnats pour le compte de cette nation. C’est ainsi qu’aux Jeux olympiques de Los Angeles 1984, il a remporté une médaille de bronze par équipe.

Lors des Jeux olympiques de Séoul 1988, l’équipe était cette fois médaillée d’or avec des partenaires comme Ludger Beerbaum, Ulrich Kirchhoff et Lars Nieberg.

Précisons par ailleurs qu’à l’occasion d’un meeting en Belgique, Franke Sloothaak a sauté une barre située à 2,40 m de hauteur. Cela constitue toujours un record dans une aire intérieure.